<![CDATA[Egon Rijpkema - Egon's blog]]>http://egonrijpkema.nl/Ghost 0.11Wed, 24 Jul 2019 06:50:34 GMT60<![CDATA[TTN Presentation]]>I recently did a small presentation on connecting an arduino to the things network (LoRaWAN). The slides can be found here.

]]>
http://egonrijpkema.nl/2017/02/17/ttn-presentation/bf960a52-578c-46ab-b854-059f88ea1d1eFri, 17 Feb 2017 09:03:04 GMTI recently did a small presentation on connecting an arduino to the things network (LoRaWAN). The slides can be found here.

]]>
<![CDATA[NRCq stiekem toch lezen.]]>Tsja, eigenlijk snap ik best dat kranten geld willen voor hun stukjes. Maar als je de tekst gewoon naar de client stuurt maar de scrolbalk vervolgens disabled, dan vraag je hier om.
Onderstaand "script" kun je laden in greasemonkey. Weet je niet wat dat is? Mooi dan verdient de NRC

]]>
http://egonrijpkema.nl/2015/08/22/nrcq-paywall/a80e9fda-a445-400c-bd20-86fab3800296Sat, 22 Aug 2015 19:51:49 GMTTsja, eigenlijk snap ik best dat kranten geld willen voor hun stukjes. Maar als je de tekst gewoon naar de client stuurt maar de scrolbalk vervolgens disabled, dan vraag je hier om.
Onderstaand "script" kun je laden in greasemonkey. Weet je niet wat dat is? Mooi dan verdient de NRC toch nog wat ;-)

]]>
<![CDATA[Encryption]]>

This is mostly a symbolical post, but after the story of Edward Snowden , I wanted to do something.
So here it is: I made a pgp key with the gnu privacy guard. gpg encryption is incorperated in most email clients, but unfortunately, it is difficult to use in combination with

]]>
http://egonrijpkema.nl/2013/06/13/encryption/79bb19a4-4507-4834-b711-cdb3e97677dbThu, 13 Jun 2013 09:38:00 GMT

This is mostly a symbolical post, but after the story of Edward Snowden , I wanted to do something.
So here it is: I made a pgp key with the gnu privacy guard. gpg encryption is incorperated in most email clients, but unfortunately, it is difficult to use in combination with a webmail client.

Update: my favourite website on technology, Ars technica has posted updated instructions on how to encrypt your email. At the same time, they point out while most of us are not going to do this. Lifehacker also has detailed instructions and an explanation on how public key encryption works.

My public key is here. And I also stored it on various key servers.

]]>
<![CDATA[Elfstedentocht 2013]]>Gosh, this really is a dormant website.
Guess I just keep it around for the yearly elfstedentocht live map. You should be able to follow me here:

]]>
http://egonrijpkema.nl/2013/05/18/elfstedentocht-2013/6f3f8bf7-7e39-4616-b3e1-889a4b2a1a9dSat, 18 May 2013 09:42:00 GMTGosh, this really is a dormant website.
Guess I just keep it around for the yearly elfstedentocht live map. You should be able to follow me here:

]]>
<![CDATA[MD scripts and tools]]>When organising my files, i came across some scripts and a modified g_density for gromacs 4.07. I made them during my research project at the md group on the influence of certain substances on the membrane. Feel free to use and modify them since that’s mostly

]]>
http://egonrijpkema.nl/2012/07/12/md-scripts-and-tools/7a72b3a7-17c1-4b98-bc99-fa68c5b813c9Thu, 12 Jul 2012 11:13:00 GMTWhen organising my files, i came across some scripts and a modified g_density for gromacs 4.07. I made them during my research project at the md group on the influence of certain substances on the membrane. Feel free to use and modify them since that’s mostly how I obtained them in the first place.
gmx_density, modified to properly centre on electro density, gromacs 4.07
VesOrder.tar.gz: Series of scripts to calculate order parameters of a sperical vesicle
PMF_Scripts.tar.gz: Series of scripts to reduce the workload if you’re doing a lot of PMF / Umbrella sampling.

]]>
<![CDATA[elfstedentocht 2012]]>Ook dit jaar doe ik weer mee met de elfstedentocht. In dit kaartje kun je tijdens de tocht zien waar we op elk moment zijn. Handig als je eten wilt brengen… ;)

Ook staat de route met doorkomsttijden van vorig jaar erop.

]]>
http://egonrijpkema.nl/2011/06/12/elfstedentocht-2012/c402ed1c-71e8-43f9-b523-bcd3682fa7aaSun, 12 Jun 2011 11:10:00 GMTOok dit jaar doe ik weer mee met de elfstedentocht. In dit kaartje kun je tijdens de tocht zien waar we op elk moment zijn. Handig als je eten wilt brengen… ;)

Ook staat de route met doorkomsttijden van vorig jaar erop.

]]>
<![CDATA[HDR pictures]]>

The last couple of years I’ve been experimenting with HDR. These are some pictures I made over the years. For my other pictures, also see the fotostream on the right.

]]>
http://egonrijpkema.nl/2011/03/26/hdr-pictures/9b835811-75ab-4e2f-884e-8910d17b2620Sat, 26 Mar 2011 11:05:00 GMT

The last couple of years I’ve been experimenting with HDR. These are some pictures I made over the years. For my other pictures, also see the fotostream on the right.

]]>
<![CDATA[Beer yeast]]>Today was the last day of the last subject of the top master courses.

In this last week we studied the budding yeast Saccharomyces cerevisiae.
This video is made using a confocal microscope and follows the division
of two mutant yeast cells during a couple of hours.

The peroxysomes of

]]>
http://egonrijpkema.nl/2011/03/01/beer-yeast/d0970ffb-ad19-4f54-b100-7686517efc5eTue, 01 Mar 2011 10:53:00 GMTToday was the last day of the last subject of the top master courses.

In this last week we studied the budding yeast Saccharomyces cerevisiae.
This video is made using a confocal microscope and follows the division
of two mutant yeast cells during a couple of hours.

The peroxysomes of the cells contain GFP. And no, this is not wildtype.

If the video doesn’ t play, click here for a direct link

This is what the cells look like under the even bigger magnification
of a transmission electron microscope.

]]>
<![CDATA[microscopy]]>Today I finished the practical part of a course in microscopy. Im way to lazy to tell you everything I did there. Let’s just say (among other thins), we analyzed amoebae. Here’s a picture of how my adopted cell moved during 7 minutes or so. Can you find

]]>
http://egonrijpkema.nl/2009/04/26/microscopy/2677769a-905e-406a-af05-48adf695023dSun, 26 Apr 2009 09:47:00 GMTToday I finished the practical part of a course in microscopy. Im way to lazy to tell you everything I did there. Let’s just say (among other thins), we analyzed amoebae. Here’s a picture of how my adopted cell moved during 7 minutes or so. Can you find it in the movie?
(the movie is xvid, use VLC or something similar)

]]>
<![CDATA[Filosofie vak]]>Ik heb laatst een algemeen aanvullend vak gevolgd bij Filosofie. “De technologische cultuur” Over wetenschap, maatschappij en de samenhang daar tussen. Misschien vraag je je af waar zoiets over gaat. En laat dat nu net een vraag van het huiswerktentamen zijn. Dus dit moest ik toch al intypen:

]]>
http://egonrijpkema.nl/2009/02/09/filosofie-vak/32d041de-36cd-4f78-8401-5e13bf5b8403Mon, 09 Feb 2009 10:44:00 GMTIk heb laatst een algemeen aanvullend vak gevolgd bij Filosofie. “De technologische cultuur” Over wetenschap, maatschappij en de samenhang daar tussen. Misschien vraag je je af waar zoiets over gaat. En laat dat nu net een vraag van het huiswerktentamen zijn. Dus dit moest ik toch al intypen:

In de eerste colleges wordt het zogenaamde moderne/verlichte “standaardbeeld” van de wetenschap geschetst. Dat komt neer op het idee dat de wetenschap stukje bij beetje de natuur ontcijfert. Natuurlijk worden er daarin weleens fouten gemaakt. Maar door toetsing van andere wetenschappers worden die dan rechtgezet en zo komen we steeds verder.
In de 60-70 er jaren stonden er filosofen/sociologen op die het daar niet mee eens waren. Zij beargumenteerden dat alle wetenschappelijke kennis niet uit de natuur komt, maar door de wetenschappers is geconstrueerd. Nu zul je denken (dat dacht ik) dat die hippies er wraak voor willen nemen dat ze op de middelbare school de exacte vakken niet snapten. Jammer genoeg is dat niet helemaal waar. Ze zijn juist tot die theorie gekomen na het bestuderen van wetenschappers in hun natuurlijke habitat (het lab, congressen etc.). Dan blijkt dat er nogal een verschil zit tussen wat wetenschappers zeggen en denken dat ze doen en dat wat ze écht doen.

Deze theorie heeft verstrekkende consequenties: Het bestaan van een objectieve waarheid wordt bijvoorbeeld verworpen. Dat betekent trouwens niet dat alles even goed is om in te geloven. Maar wat waarheid dan wel is en of er niet toch een paar dingen zijn die los van beschrijvingen gewoon bestaan. (bijvoorbeeld een steen) Daar verschilt men over van mening.
Vervolgens wordt Bruno Latour behandeld. Hij betoogt dat niet alleen de wetenschappers maar ook de dingen die ze bestuderen, de wetenschappelijke kennis construeren. Anders zouden sociologen natuurlijk ook alle andere wetenschappen kunnen verklaren. De door hem ontwikkelde denkrichting heeft interessante gevolgen bij het bepalen van een standpunt over het raakvlak tussen politiek, technologie en maatschappij. Hij heeft het over een netwerk van actoren rond een technologie. Dit netwerk bestaat uit wetenschappers en hun technologie maar ook uit politici en burgers. Het al of niet succesvol zijn kan niet worden teruggebracht tot het falen of slagen van een van deze actoren. En als het succesvol is, dan heeft de wetenschapper de maatschappij (mede) veranderd en daarmee politiek bedreven, zij het met andere middelen dan in ze in den Haag gebruiken.
Hier kun je vervolgens op verschillende manieren mee om gaan. Wetenschappers dan maar kiezen lijkt niet zo handig. Maar misschien moeten we meer doen aan inspraakprocedures en van die brede maatschappelijke discussies organiseren, zoals bijvoorbeeld toen met Terlouw over kernenergie.
Of moeten we misschien, als we ons afvragen of een bepaalde techniek wel zon goed idee is, een concurerende techniek wat helpen, zodat de consument meer keuzemogelijkheid in bijvoorbeeld de supermarkt heeft, om zo de maatschappij te veranderen?

]]>
<![CDATA[Do the twist]]> Nice looking isn't it? Perhaps I'll explain this later (when I understand it) Ok, perhaps not.

]]>
http://egonrijpkema.nl/2008/12/31/do-the-twist/16d94c40-e3c8-4974-8bdc-ad8c8bcf4b2dWed, 31 Dec 2008 23:18:00 GMT Nice looking isn't it? Perhaps I'll explain this later (when I understand it) Ok, perhaps not.

]]>